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美国科学家团队开发出适应于CRISPR/Cas13 系统的 guide RNA设计体系

日期:2020-04-15 16:54 作者: 来源:农业农村部科技教育司
 
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美国科学家团队开发出适应于CRISPR/Cas13 系统的 guide RNA设计体系,研究成果于2020316日在《自然·生物技术》上在线发表。研究表明,gRNA存在保证其靶向活性的核心区域,其中心位于相对于gRNA 5’端第18个核苷酸,并发现当错配位于靶标位点U碱基时,对敲除效率影响较大。另外,研究人员将重点放在靶向外显子的gRNA设计和敲除能力预测上,并创建了精确度更高的预测新模型(RFcombined模型)。该研究为CRISPR/Cas13d执行了一系列筛选,并为最佳的gRNA设计定义了规则,提供了Cas13靶向性的详细描述和高活性gRNAs的预测模型,为大规模进行RNA靶向筛选的设计提供了有价值的平台。(来源:自然·生物技术)