欧盟法院于2018年7月25日裁定，通过基因编辑获得的生物属于转基因生物，且原则上受转基因生物管理条例规定的约束。2019年5月14日，荷兰在欧盟农业和渔业理事会会议要求欧盟委员会在其工作计划中增加对欧盟基因编辑等新兴生物技术的转基因生物立法的审查，并得到12个成员国的支持。2019年9月6日，欧盟理事会芬兰主席要求欧盟委员会提交有关基因编辑监管情况的研究和建议。应荷兰和芬兰的具体要求，2019年11月8日，欧盟理事会要求欧盟委员会在2021年4月30日之前提交1份有关欧盟基因编辑技术现状的研究报告和提案，并附上影响评估。
随后，多方主体关于欧盟的基因编辑监管法规及其后续进展表达了各自的态度和观点。欧盟部分成员国、政府组织、科学家团体和产业组织反对把基因编辑纳入转基因监管框架的监管政策，认为其严重阻碍了基因编辑技术的发展，呼吁欧盟当局对现行法规进行修改。欧盟委员会首席科学顾问组认为，该法令意味着利用CRISPR/Cas9等基因编辑技术开发的新产品需要经过欧盟冗长的审批流程，加重监管成本；欧洲科学与人文学院联合会建议欧盟修改基因编辑的监管政策，认为对于生物技术的监管应该依据植物本身的特性而非技术，通过基因编辑技术获得的植物和常规育种的植物同等安全；欧洲科学院科学咨询委员会认为把基因编辑纳入转基因监管框架的监管政策将阻碍农业创新；欧洲生物产业协会指责欧洲法院的裁决并没有提供清晰的监管方向，认为为生物技术育种建立一个更清晰、透明并以科学为基础的监管程序至关重要；由132个欧洲研究机构和协会组成的欧洲基因编辑可持续农业网络认为基因编辑技术在应对人口增加、气候变化和环境问题方面有重要作用，建议欧盟理事会、欧盟议会和欧盟委员会对把基因编辑纳入转基因监管框架的监管政策进行修改；欧洲农民和农业合作社认为把基因编辑纳入转基因监管框架的监管政策严重影响欧洲植物育种进程和生物多样性与可持续农业的发展。
部分支持非转基因的组织和环保机构却对欧洲法院的裁定表示支持，认为现行法规能够保护消费者和生物多样性。德国非转基因食品协会支持欧洲法院的裁定，宣布已经开发出针对基因编辑油菜的检测方法，并得到欧盟转基因生物网络实验室成员奥地利环境署的验证；欧洲绿色和平认为把基因编辑纳入转基因监管框架的监管政策对保护消费者和环境是必要的；生物技术影响评估研究所认为有必要对基因编辑技术进行严格监管，因为CRISPR/Cas9等基因编辑技术存在脱靶风险，可能对生物多样性造成破坏；环保组织地球之友也支持欧洲法院的裁定，呼吁将所有基因编辑产品都纳入监管范围，评估其对健康和环境的影响，并统一标识。（来源：欧洲法院、欧盟委员会及各组织官网）